Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccer2J3QPU5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms