Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm21976J3QNN2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm21976J3QNN2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm21976J3QNN2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm21976J3QNN2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm21976J3QNN2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21976J3QNN2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms