Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms