Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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