Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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