Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Igkv1-99F6XWB2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Igkv1-99F6XWB2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms