Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms