Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rnf217D3YYI7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rnf217D3YYI7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rnf217D3YYI7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rnf217D3YYI7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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