Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrt4B2RU40 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms