Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.9 ms