Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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