Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Col4a3Q9QZS0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Col4a3Q9QZS0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Col4a3Q9QZS0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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