Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms