Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gpa33Q9JKA5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms