Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccl28Q9JIL2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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