Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms