Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms