Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms