Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Sgms1Q8VCQ6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgms1Q8VCQ6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms