Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms