Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Abcf3Q8K268 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms