Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms