Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ercc8Q8CFD5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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