Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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