Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek11Q8C0Q4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms