Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep55Q8BT07 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep55Q8BT07 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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