Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms