Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Htatsf1Q8BGC0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms