Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Amigo1Q80ZD8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Amigo1Q80ZD8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Amigo1Q80ZD8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Amigo1Q80ZD8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Amigo1Q80ZD8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Amigo1Q80ZD8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Amigo1Q80ZD8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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