Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms