Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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