Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms