Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms