Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BB287469Q3UT53 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms