Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc1Q3UPH1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms