Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms