Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms