Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NeblQ0II04 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NeblQ0II04 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms