Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col9a2Q07643 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms