Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms