Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pou1f1Q00286 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou1f1Q00286 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms