Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rad23aP54726 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms