Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CitP49025 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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