Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsx2P31316 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms