Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ggta1P23336 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ggta1P23336 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ggta1P23336 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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