Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms