Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms