Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb7P09024 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb7P09024 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms