Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Timm44O35857 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Timm44O35857 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms