Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcshO08795 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms